Очередное обновление моделей серии 3 началось в 1998 г. Тогда стартовало новое поколение седанов типа Е46. За два года семейство "троек" пополнилось новыми купе, универсалами Touring и кабриолетами. В конце 2000 г. появились 3-дверные хэтчбеки Compact II, созданные на шасси Е46.